የጤና ፕሮግራሞች ዘርፍ የህክምና አገልግሎቶች ዘርፍ በውስጡ ሁለት ዳይሬክቶሬቶች የሚገኙ ሲሆን እነሱም፦ 1. የህክምና አገልግሎት ዳይሬክቶሬት እና 2. የመድሐኒትና ህክምና መሳሪያዎች ዳይሬክቶሬት ናቸው፡፡